アライメント
DNAの塩基配列やタンパク質のアミノ酸配列などの配列情報は，系統解析を行う際，歴史的に見て"同じ場所"を比較する必要がある．この計算をアライメントと言う．
アライメントは配列が短い場合は手作業で可能であるが，配列が長くなると不可能になる．このため一般にプログラムを用いて計算させる．
Clustal W
アライメントを行うプログラムとして代表的なものにClustal Wがある．DDBJではClustal Wを用いてアライメントを行うページを提供している．
実習ではDDBJの提供するClustal Wのページを用いてアライメントを行う．Clustal Wで計算させる配列データはいくつかの形式で表記できるが，今回はFASTA形式のデータを作成して，送信する．
データ以外に，計算の際のパラメータを変更するオプションが容易されている．今回は，TREEオプションをOFFとして，他のパラメータは標準のままで計算を行う．計算結果については，解析結果の項で，E-Mailを指定する．