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微生物について（Microorganism）

肉眼（Naked Human Eye）で判別できないような微小な（Microscopic）生物（Organism）を微生物（Microorganism、Micro Organism、Micro-organism、Microbe）と呼ぶ。 　その中には多様な生物種（Biological Species）が含まれる。その多くを原核生物（Prokaryote）が占める。 　プランクトン（Plankton）という用語は浮遊生物（Drifting Organisms）を指すが、微生物と同様の意味で使われることも多い。

• 生物一般は『生物学』のページを参照。
• 生態系は『生態系とは』のページを参照。
• 過去の生物については『化石とは』のページを参照。
• 種の定義は『化石とは』のページを参照。
• 植物は『植物について』のページを参照。
• 菌類については『菌類について』のページを参照。
• 菌根については『菌根について』のページを参照。
• 土壌は『土壌とは』のページを参照。

リンク

【リンク】

• 微生物　　http://protist.i.hosei.ac.jp/GBIF/DB_list/list_1.html
  　原生生物情報サーバの『日本における生物多様性関連Webサイト一覧』の中のぺージ。

【全体】

• 微生物　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%BE%AE%E7%94%9F%E7%89%A9
  Microorganism　　http://en.wikipedia.org/wiki/Microorganism
  Category:微生物学　　http://ja.wikipedia.org/wiki/Category:%E5%BE%AE%E7%94%9F%E7%89%A9%E5%AD%A6
  Category:Microbiology　　http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Microbiology
  微生物学　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%BE%AE%E7%94%9F%E7%89%A9%E5%AD%A6
  　『微生物学（びせいぶつがく、英 Microbiology）とは微生物を対象とする生物学の一分野。
  　微生物とは細菌、原生生物、ウイルス、真菌類など、顕微鏡的大きさ以下の生物を指す。しかし、微生物学という用語を用いられる場合、主として細菌類をその対象とする場合が多い。
  　主に生化学的な解析を行う。現在は地球科学的因子の一つとして微生物を含めた微生物生態学のようなラージスケールでの解析も行っている。』
  Microbiology　　http://en.wikipedia.org/wiki/Microbiology
• 電子顕微鏡で見た病原体　　http://www.affrc.go.jp/AVEM/Japanese/⇒http://niah.naro.affrc.go.jp/disease/EM/
  　農林水産研究WWWサーバーの中の動物衛生研究所によるページ。
• 微生物インベントリー (microForce)⇒microForce 　　http://www.niaes.affrc.go.jp/inventry/microorg/index.html
  日本野生植物寄生・共生菌類目録 　　http://www.niaes.affrc.go.jp/inventry/microorg/mokuroku/mokuroku.html
  日本（植物体上）糸状菌類図鑑⇒日本産糸状菌類図鑑　　http://www.niaes.affrc.go.jp/inventry/microorg/mokuroku/zukan.html
  　（独）農業環境技術研究所農業環境インベントリーセンターの『農業環境インベントリーセンター・データベース集』の中のページ。
• 微生物学講座　　http://www.bacct.com/knowledge/lecture/01/index.html
  　日本細菌検査（株）による。
• 微生物系統保存施設 (MCC-NIES)（不明）　　http://www.nies.go.jp/biology/mcc/home_j.htm
  　（独）国立環境研究所（NIES）の付属施設。

【組織・機関】

• 日本微生物生態学会　　http://wwwsoc.nii.ac.jp/jsme2/homeJ.html
  　『日本微生物生態学会誌』、『Microbes and Environments』、『Link集』など。
• 日本土壌微生物学会　　http://wwwsoc.nii.ac.jp/jssm/
  　『学会誌（土と微生物）』、『土壌微生物写真館』など。
• 植物微生物研究会（不明）　　http://www.affrc.go.jp:8001/jspmi/
  　『植物微生物研究会は、共生窒素固定菌・植物病原菌・菌根菌等の微生物と植物との相互作用（感染機作、シグナル交換の分子生物学、生化学、生態学、利用等）に関する研究会です。』
  ⇒植物微生物研究会　第19回研究交流会　　http://www.kazusa.or.jp/workshop/PMI2009/index.html
• 日本食品微生物学会　　http://www.jsfm.jp/
  　『学会誌目次』など。
• 日本プランクトン学会　　http://www.plankton.jp/
  　『日本プランクトン学会報』など。
• American Society for Microbiology　　http://www.asm.org/
  　『Journals』など。

【ウイルス】（virus）〔生物学上は非生物である〕

• ウイルス　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%A6%E3%82%A3%E3%83%AB%E3%82%B9
  　『ウイルス (virus) は、他の生物の細胞を利用して、自己を複製させることのできる微小な構造体で、タンパク質の殻とその内部に詰め込まれた核酸からなる。ウィルス、ビールス、濾過性病原体、病毒と表記することもある。』
  Virus　　http://en.wikipedia.org/wiki/Virus
  Category:ウイルス　　http://ja.wikipedia.org/wiki/Category:%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B9
  Category:Viruses　　http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Viruses
• 日本ウィルス学会　　http://jsv.umin.jp/index.html
• ウイルス図鑑　　http://protist.i.hosei.ac.jp/virus/top.html
  　矢崎和盛（法政大学）・後藤俊幸（京都大学）・月井雄二（法政大学）の諸氏による。

【細菌】（bacteria）

• 真正細菌　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%B4%B0%E8%8F%8C
  　『真正細菌 (しんせいさいきん、英語 bacteria(複数) ; bacterium(単数) ; eubacteria(複数) ; eubacterium(単数)) は生物分類上のドメインの一つであり、古細菌が持たないアセチルムラミン酸を含んだ細胞壁を持つ原核生物のこと。バクテリアとも呼ばれる。細胞外マトリクスの構造の違いによってグラム陰性菌とグラム陽性菌に分類される（グラム染色）。植物や動物とは異なりきわめて多様な代謝系や栄養要求性を示し、生息環境も生物圏と考えられるすべての環境（主として水圏）が含まれる。また物質循環においても有機物の分解過程という重要な位置を占めている（硝化、脱窒過程など）。（以下略）』
  Bacteria　　http://en.wikipedia.org/wiki/Bacteria
  Category:真正細菌　
  Category:Bacteria　　http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Bacteria
• Bergey's Manual Trust　　http://www.cme.msu.edu/Bergeys/⇒http://www.bergeys.org/
  　Department of Microbiology and Molecular Genetics（Michigan State University）による。

【古細菌】

• 古細菌　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%8F%A4%E7%B4%B0%E8%8F%8C
  Archaea　　http://en.wikipedia.org/wiki/Archaea
  Category:古細菌　　http://ja.wikipedia.org/wiki/Category:%E5%8F%A4%E7%B4%B0%E8%8F%8C
  Category:Archaea　　http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Archaea

【原核生物】（prokaryotes、Prokaryota）

• 原核生物　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%8E%9F%E6%A0%B8%E7%94%9F%E7%89%A9
  　『細胞に核を持たない(原核細胞から構成される)生物のことを原核生物（英: prokaryote; プロカリオート）という。 ホイタッカーの五界説の界の一つ。（以下略）』
  Prokaryote　　http://en.wikipedia.org/wiki/Prokaryote
• Digital Atlas of Actinomycetes（放線菌）　　http://www.nih.go.jp/saj/DigitalAtlas/
  　The Society for Actinomycetes Japanによる。
  　『放線菌（order Actinomycetales）は、グラム陽性細菌に所属する一分類群です。 現在までに正式に発表された原核生物（細菌、古細菌）の種は、約1,000属、5,000種ですが、このうち放線菌は約100属、1,000種を占めています。 土壌を主たる生息域とし、大部分は絶対好気性で分離･培養･保存の可能な微生物です。 放線菌が他の細菌群と区別して扱われる理由は、次の2点です。
  �@原核生物でありながら、多くの放線菌は分岐を伴う糸状の生育を示し、多様な形態を呈する。また、一般的に胞子を形成し、中には胞子嚢や運動性胞子を形成する種も含まれる。
  �Aこれまでに微生物から発見された抗生物質は 約10,000化合物と言われているが、その3分の2はStreptomyces属を中心にした放線菌の生産物であり、実用化されたものも少なくない。』
• アオコをつくる藍藻　　http://research.kahaku.go.jp/botany/aoko/aoko.html
  　国立科学博物館植物研究部による。『アオコとは？』、『藍藻とは？』、『藍藻の分類』、『浮遊藍藻データベース』など。

【原生生物】（protists、Protista）

• 原生生物　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%8E%9F%E7%94%9F%E7%94%9F%E7%89%A9
  　『原生生物（げんせいせいぶつ）とは、生物の分類の一つ。真核生物のうち、菌界にも植物界にも動物界にも属さない生物の総称。もともとは、真核で単細胞の生物、および、多細胞でも組織化の程度の低い生物をまとめるグループとして考えられたものである。』
  Protist　　http://en.wikipedia.org/wiki/Protist
  Category:原生生物　　http://ja.wikipedia.org/wiki/Category:%E5%8E%9F%E7%94%9F%E7%94%9F%E7%89%A9
  Category:Protista　　http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Protista
• 原生生物情報サーバ　　http://protist.i.hosei.ac.jp/index-J.html
  　『原生生物図鑑』、『微生物デジタル標本館』、『インターネットと生命科学』など。
  　『このデータベースは，総合研究大学院大学 共同研究「生物形態資料画像データベースの構築」（研究計画３年，1997-1999），および，平成９年度科学技術振興調整費による 知的基盤整備推進制度採択課題 「生物系研究資材のデータベース化及びネットワークシステム構築のための基盤的研究開発」 （研究計画５年，1997-2001）に参加しています。また，このデータベースは科研費（試験研究Ｂ　課題番号 07558052）の補助を受けました。』
• 藻類画像データ　　http://www.biol.tsukuba.ac.jp/%7Einouye/ino/phycological_images.html
  　筑波大学生物科学系植物系統・分類研究室による。
• 珪藻の世界　　http://www.u-gakugei.ac.jp/%7Emayama/diatoms/Diatom.htm
  　東京学芸大学生物学研究室の真山茂樹氏による。
• Marine Diatom World 日本沿岸水域の海産珪藻類データベース　　http://www.ndu.ac.jp/%7Et-nagumo/index.html
  　南雲　保氏（代表）による。
• 珪藻図鑑　　http://www.lbm.go.jp/ohtsuka/atlas/index.html
  　滋賀県立琵琶湖博物館の大塚泰介氏による。
• 土壌原生生物データベース（Soil Protozoan Images）（不明）　　http://soilprot.job.affrc.go.jp/index.html
  　東北農業研究センター 畑地利用部の坂神たかね・山初和美・島野智之の諸氏による。『原生動物(生物)の分類体系』、『有殻アメーバ』、『土壌性繊毛虫』、『用語集』、『同定法』、『文献』、『関連情報』など。

【下水道】

• 活性汚泥動物園　　http://www.siset.or.jp/doubutu/index.htm⇒http://www.siset.or.jp/doc/doubutsu/
  　（社）日本下水道施設業協会の中のページ。
• 微生物図鑑　　http://www.gesui.metro.tokyo.jp/kids/biozukan/biozukan.htm
  　東京都下水道局の『キッズ下水道』の中のページ。

【プランクトン】

• プランクトン　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%97%E3%83%A9%E3%83%B3%E3%82%AF%E3%83%88%E3%83%B3
  　『プランクトン (Plankton・浮遊生物) とは、水中や水面を漂って生活する生物の総称。様々な分類群に属する生物を含む。 生態系では生態ピラミッドの下層を構成する重要な者である。』
  Plankton　　http://en.wikipedia.org/wiki/Plankton
• micro-world　　http://www.biwa.ne.jp/%7Eh-asai/
  　滋賀県立東大津高等学校の 浅井　浩氏による。
• 琵琶湖のプランクトンホームページ（変更）　　http://www.pref.shiga.jp/biwako/plankton/index.htm
  　滋賀県立衛生環境センターによる。
  ⇒琵琶湖のプランクトン　　http://www.lberi.jp/root/jp/24pl/planktonzukan/bkjhindex.htm
• 福井県のプランクトン　　http://www.erc.pref.fukui.jp/center/mizu/pla/index.html
  　福井県衛生環境研究センター 環境保全部による。
• The World of Protozoa, Rotifera, Nematoda and Oligochaeta　　http://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/
  　Inamori Yuhei氏による。
• 微生物の海（不明）　　http://www.ecosystem.ori.u-tokyo.ac.jp/microbiology/members/hama/hama3.html
  海洋微生物生態学入門　　http://home.hiroshima-u.ac.jp/hubol/class/mmehama.html
  　浜崎恒二氏による。
• 日本プランクトン学会　　http://www.plankton.jp/sub04.html
• 横浜沿岸域のプロチスタ　　http://www.biol.tsukuba.ac.jp/~algae/YMFF/
  　筑波大学BioD508による。
• Plankton*Net @ Roscoff（変更）　　http://planktonnet.sb-roscoff.fr/index.php
  ⇒Plankton*Net (2006-2008) 　　http://www.sb-roscoff.fr/Phyto/index.php?option=com_content&task=view&id=147&Itemid=249
• プランクトン画像データベース（不明）　　http://www.shimoda.tsukuba.ac.jp/%7Eseitai/planktonDB/pdbindex.html
  　筑波大学下田臨海実験センター海洋生態学研究室によるMarine Ecologyの中のページ。

【ベントス】

• 底生生物　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%BA%95%E7%94%9F%E7%94%9F%E7%89%A9
  Benthos　　http://en.wikipedia.org/wiki/Benthos
  生活型 (水生生物)　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%94%9F%E6%B4%BB%E5%9E%8B_%28%E6%B0%B4%E7%94%9F%E7%94%9F%E7%89%A9%29#.E3.83.99.E3.83.B3.E3.83.88.E3.82.B9
  ⇒http://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%94%9F%E6%B4%BB%E5%9E%8B_%28%E6%B0%B4%E7%94%9F%E7%94%9F%E7%89%A9%29
• 日本ベントス学会　　http://www.benthos-research.info/
  　『Plankton & Benthos Research』、『日本ベントス学会誌』など。

【有孔虫】

• 有孔虫　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%9C%89%E5%AD%94%E8%99%AB
  　『有孔虫（ゆうこうちゅう、Foraminifera; ラテン語 foramen '穴' + -fer '含む'）は、主として石灰質の殻（test）と網状仮足を持つアメーバ様原生生物の一群である。普通は1mm以下の大きさだが、大きいものでは5cm程度、化石では最大で19cmに達する。現生・化石合わせて25万種が知られており、各種の指標生物として有用である。殻が堆積して石灰岩を形成することがあり、サンゴ礁における炭酸カルシウムの沈殿にも非常に貢献している。』
  Foraminifera　　http://en.wikipedia.org/wiki/Foraminifera
  Category:Foraminifera　　http://en.wikipedia.org/wiki/Category:Foraminifera
  フズリナ　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%95%E3%82%BA%E3%83%AA%E3%83%8A
  Fusulinid　　http://en.wikipedia.org/wiki/Fusulinid
• Introduction to the Foraminifera　　http://www.ucmp.berkeley.edu/foram/foramintro.html
• 浮遊性有孔虫統合画像データベース　　http://www.jamstec.go.jp/iorgc/godac/index.html
  　地球環境観測研究センター（IORGC）の古海洋環境復元グループと国際海洋環境情報センター（GODAC）による。
• 有孔虫研究会　　http://www.foram.jp/index.html

【円石藻】

• 円石藻　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%86%86%E7%9F%B3%E8%97%BB
  　『円石藻（えんせきそう）は、細胞表面に円石と呼ばれる円盤型の構造を持つ植物プランクトンである。分類学上はハプト植物門に属する単細胞真核藻類である。』
  Coccolithophore　　http://en.wikipedia.org/wiki/Coccolithophore
• ハプト植物門　　http://www.biol.tsukuba.ac.jp/~inouye/ino/h/haptophytes.html
  　筑波大学生物科学系植物系統分類学研究室によるの藻類画像データの中のページ。
• 円石藻とは？ 　　http://www.sbs.life.tsukuba.ac.jp/Kawachi/cocco.htm
  　筑波大学の河地正伸氏による。
• ハプトってなんだろう?　　http://www.kahaku.go.jp/special/past/bisyoso/ipix/mo/3/3_10.html
  　国立科学博物館による。

【放散虫】

• 放散虫　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%94%BE%E6%95%A3%E8%99%AB
  　『放散虫（ほうさんちゅう 、Radiolaria; ラテン語 radiolus, radius '放射状の棒'の縮小辞）とは、原生生物の一群である。主として海のプランクトンとして出現する単細胞生物で、珪酸質などからなる骨格を持ち、そのため微化石としても発見される。エルンスト・ヘッケルが研究したことでもよく知られている。』
  Radiolarian　　http://en.wikipedia.org/wiki/Radiolarian

【珪藻】

• 珪藻　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E7%8F%AA%E8%97%BB
  　『珪藻（ケイソウ）は不等毛植物門珪藻綱に属する単細胞性の藻類である。細胞が珪酸質の被殻 (frustule) に入っているのが特徴である。殻の形態が放射相称を示すものを中心珪藻、一本の対称軸をもって左右対称であるものを羽状珪藻と呼ぶ。』
  Diatom　　http://en.wikipedia.org/wiki/Diatom
• 珪藻の世界　　http://www.u-gakugei.ac.jp/~mayama/diatoms/Diatom.htm
  　東京学芸大学の真山茂樹氏による。
• 珪藻図鑑　　http://www.lbm.go.jp/ohtsuka/atlas/index.html
  　滋賀県立琵琶湖博物館の大塚泰介氏による。
• 日本珪藻学会　　http://wwwsoc.nii.ac.jp/jsdt/⇒http://diatomology.org/
  　会誌『DIATOM』など。
• 水生植物図鑑　　http://www.gikenko.co.jp/seihin/plant/database/illust.htm
  　技研興業（株）製品事業部による水辺の植物の中のページ。
• ミクロの生物「珪藻」から川の環境を見つめてみよう　　http://lbm.ab.a.u-tokyo.ac.jp/~keiso/diatom4/index.html
  http://library.u-gakugei.ac.jp/diatom/
  　真山茂樹・加藤和弘・大森 宏・清野聡子氏らによる。
• 珪藻の世界　　http://www.ndu.ac.jp/~t-nagumo/diatom_world/index.htm
  　Diatom World。南雲　保 ・出井雅彦・長田敬五氏らによる。
• 3-3．カイアシ類着生珪藻　　http://home.hiroshima-u.ac.jp/fishlab/Dhaku/epizoic%20diatom/epizoic%20diatom.htm
  　広島大学生物圏科学研究科瀬戸内圏フィールド科学教育研究センター竹原ステーション（水産実験所）による広島大学デジタル博物館　地球で最も繁栄している甲殻類『カイアシ類』の中のページ。
• 淡水珪藻画像集　　http://keisou.hp.infoseek.co.jp/⇒http://cyclot.sakura.ne.jp/keisougazou/
• 日本沿岸水域の海産珪藻類データベース　　http://www.ndu.ac.jp/~t-nagumo/
  　MARINE DIATOM WORLD（代表：南雲保氏）による。

【渦鞭毛藻】

• 渦鞭毛藻　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%B8%A6%E9%9E%AD%E6%AF%9B%E8%97%BB
  　『渦鞭毛藻（うずべんもうそう）類は2本の鞭毛を持つ単細胞藻類の一群である。海洋プランクトンが多いが、淡水環境にも普通に見られる。渦鞭毛藻は一次生産者であることから食物連鎖中の重要な位置を占めるが、中でも褐虫藻は海洋動物や原生動物の細胞内共生体であり、サンゴ礁の生成に極めて重要な役割を担っている。渦鞭毛藻の約半分は従属栄養性で、他の原生動物を捕食して生活するが、光合成を行う渦鞭毛藻のなかにも活発な捕食行動を行うものもいる。中には寄生性のものもある。』
  Dinoflagellate　　http://en.wikipedia.org/wiki/Dinoflagellate
• 渦鞭毛植物　Dinophyta　　http://protist.i.hosei.ac.jp/taxonomy/Phytomastigophora/Dinophyta/index.html
  　原生生物図鑑の中のページ。
• 新型赤潮生物ヘテロカプサのページ⇒新型赤潮生物ヘテ・遷プサのページ　　http://www.nnf.affrc.go.jp/hcaphp/index.htm⇒http://feis.fra.affrc.go.jp/hcaphp/index.htm
  　（独）水産総合研究センター瀬戸内海区水産研究所の中のページ。
• 渦鞭毛藻のホームページ（変更）　　http://bio2.sci.hokudai.ac.jp/Dinohome/Welcome.html
  ⇒Dinoflagellate　　http://www.sci.hokudai.ac.jp/~horig/Dinohome/Welcome.html
  　堀口健雄氏による。
  渦鞭毛藻の世界を探る（不明）　　http://www.hokudai.ac.jp/science/science/H13_05/seibutu/Keitou2.htm⇒http://www.sci.hokudai.ac.jp/science/science/H13_05/seibutu/Keitou2.htm

【デトリタス】

• デトリタス　　http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%87%E3%83%88%E3%83%AA%E3%82%BF%E3%82%B9
  　『デトリタス(Detritus)とは、生物遺体や生物由来の物質の破片や微生物の遺体、あるいはそれらの排泄物を起源とする微細な有機物粒子のことであり、通常はその表面や内部に繁殖した微生物群集を伴う。陸上の土壌に混入した有機物片のことを指す場合もあるが、多くの場合は水中のそれを指す。プランクトンとともに水中の懸濁物（けんだくぶつ、セストン）の重要な構成要素であり、堆積物にも多く含まれる。i を二重母音で発音してデトライタスとも表記するが、それが英語本来の発音であり、デトリタスという呼称は英語として正しくない。』
  Detritus　　http://en.wikipedia.org/wiki/Detritus

【講義ノート】

• 微生物の世界 (Web講義室)　　http://micro.fhw.oka-pu.ac.jp/microbiology/microbiology-index.html
  　山本耕一郎氏による。

【用語集】

• 微生物用語辞典⇒微生物の用語解説　　http://www.microbes.jp/dic/main.html
  　微生物管理機構による。『環境と微生物』なども。
• （用語集）（不明）　　http://soilprot.job.affrc.go.jp/terminology/Jpn-a.html
  　土壌原生生物データベース（Soil Protozoan Images）の中のページ。

【その他】

• 21世紀初頭の藻学の現況　　http://wwwsoc.nii.ac.jp/jsp/jjp/File-list-set.html
  　日本藻類学会の『刊行物』の『日本藻類学会創立50周年記念出版「21世紀初頭の藻学の現況」』の中のページ。
• 温泉微生物−フィールドワークと研究−　　http://www.mnc.toho-u.ac.jp/v-lab/onsen/
  　東邦大学 医学部　生物学研究室の杉森賢司氏による。
• 病気のバイオサイエンス　　http://www.biken.osaka-u.ac.jp/biken/BioScience/index.html
  　大阪大学微生物病研究所の中のページ。

【2003】

• 堀越孝雄・二井一禎（編著）（2003）による〔『土壌微生物生態学』（115p）から〕【見る→】

プランクトン

【2010】

• 浜崎（HP）による『海洋微生物生態学入門』から
  

  〔浜崎恒二氏による『海洋微生物生態学入門』から〕

有孔虫

【2010】

• 国際海洋環境情報センターによる『浮遊性有孔虫データベース』から
  

  国際海洋環境情報センターによる浮遊性有孔虫データベースから 現在の浮遊性有孔虫の例（グロビゲリナ、Globigerina）。約0.1ミリメートル程度の大きさ。糸状の仮足は剥がれてしまっていて見えない。