PPR タンパク質のリストを作ってみる。たくさんあるので未完成のままである。変異形質などが論文として報告されているものを優先する。乾燥耐性との関係を示した論文が多い。これは乾燥耐性というよりも、気孔が開きにくいため水分を節約できるかららしい (このことは ndufs4 の論文 Remodeled respiration in ndufs4 with low phosphorylation efficiency suppresses Arabidopsis germination and growth and alters control of metabolism at night. Meyer EH, Tomaz T, Carroll AJ, Estavillo G, Delannoy E, Tanz SK, Small ID, Pogson BJ, Millar AH. Plant Physiol. 2009 Oct;151(2):603-19. などに記載されている）。気孔にはミトコンドリアも存在する。その機能に関する論文も発表されている。Arabidopsis guard cell chloroplasts import cytosolic ATP for starch turnover and stomatal opening. Lim SL, Flütsch S, Liu J, Distefano L, Santelia D, Lim BL. Nat Commun. 2022 Feb 3;13(1):652. doi: 10.1038/s41467-022-28263-2. PMID: 35115512
| AGI | Annotation | 特徴 | Subfamily | Uniprot | ||
| At2g02750 | PCMP-E22 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 高温ストレスで発現量が高くなる GSE11758 | PCMP-E subfamily | https://www.uniprot.org/uniprot/Q1PFA6 | ||
| At2g45350 | CRR4 | 葉緑体で働く DYW1 タンパク質と結合して働く | DYW1 は E+ and DYW motifs をもつ | https://www.uniprot.org/uniprot/O22137 | ||
| At4g02820 | RESISTANCE TO PHYTOPHTHORA PARASITICA 7 (AtRTP7) | PMID: 35262740 P-type PPR タンパク質の一種 NAD7 のスプライシングに関与している | ||||
| At3g16890 | PPR40 | PMC2287346 など Pentatricopeptide (PPR) domain protein 40 enhanced sensitivity to salt abscisic acid and oxidative stress 生育が遅い | ||||
| At5g11310 | SOAR1 | PMID: 26093896 | ||||
| At2g13600 | SLO2 | PMID: 23990142 生育が遅い ロゼットが乾燥ストレスに強くなる（Figure 4）。気孔が閉じている割合が多い | ||||
| At5g08490 | SLG1 | PMID: 22248025 slg1 は ABA 感受性が高く、乾燥に強くなる NAD3 に 作用 乾燥に強くなるのはロゼットの時期 しかし生育は遅い 気孔の閉じ方が強い | ||||
| AT1G15480 | PRECOCIOUS1 (POCO1) | PMID: 31219634 と 32397956 花成のタイミングが変化 RNA-seq データ E-MTAB-8912 | P-class | |||
| AT1g74900 | OTP43 | PMID: 17965268 NAD1 遺伝子のイントロン 1 のスプライシングが異常 | ||||
| At4g14850 | LOI1 HAS2 | PMID: 19929879 HMG-CoA reductase 阻害剤 Lovastatin 感受性が低下する（根の伸長の阻害が起きにくい） nad4、 ccb203 and cox3 の editing に働く ABA-deficiency のサプレッサー変異（ABA に感受性が高い）としても見いだされた (HAS2 PMID: 25708384) | DYW subclass | |||
| At2g22410 | SLO1 | PMID: 20497377 SLOW GROWTH1 nad4 and nad9 を標的にする | E motif | |||
| PPR035 and PPR406 | PMID: 35928709 「 Interestingly the RNA editing efficiency was positively correlated with many agronomic traits while it was negatively correlated with drought tolerance. 」多数のイネ品種で比較している | |||||
| PPR56 and PPR65 | PMC9508816 Physcomitrium patens の PPR タンパク質 ヒト細胞に導入すると、細胞質に存在する mRNA を編集する活性を示した | |||||
| At2g20720 | アンチマイシン、オリゴマイシン処理（短時間）で mRNA 量が増加 GSE41136 GSE57140 GSE38965 | |||||
| AT1G80270 | PPR596 | Glucose 処理で発現量が高まる GSE40245 | ||||