http://celldesigner.org/index.html が、本拠地
CellDesigner については、http://q-bio.jp/wiki/Main_Page 定量生物学の会 のページの、http://q-bio.jp/wiki/%E7%90%86%E8%AB%96%E7%94%9F%E7%89%A9%E5%AD%A6%E5%9F%BA%E7%A4%8E%E3%81%BE%E3%81%A8%E3%82%81 理論生物学基礎まとめ のページで公開されている、第四回年会 数値計算チュートリアル資料 (15MB) （慶應義塾大学 舟橋先生による） に紹介されている。
守屋先生のページ http://tenure5.vbl.okayama-u.ac.jp/HM_blog/ に、実際にモデルを作成して分析する、とても参考になるすばらしい解説が公開されている。