[bioinfo]マイクロサテライトマーカーのプライマー設計（2020年版）

久々にマイクロサテライト領域の解析をしようと思ったら、ツールとしてはmsatcommander以外にまともなツールがなかったという話。以下、ほぼ防備録。

msatcommanderのwindows版はversion 0.8.2でディスコン、windows7以降のOSではまともに動かない。kraitが10Gbを超える大規模データを扱えるが、プライマー設計はバグで動かない。

結局、古いUbuntuのディストリビューションにインストールしていたmsatcommanderのversion 1.0.8 betaが正常に動作してくれたので、なんとか目的を果たすことができた。

そういうわけで、枯れたマーカーには枯れたソフトウェアが依然として有効ということ。