[bioinfo]nanopore readの精度向上のためのbasecalling法 (250129 ver.)
1. Obtain pod5 data
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プロトコル
[bioinfo]STARでmappingしたデータをgatkでsnp callする際のtips
STARでmappingしてbam出力し
続きを読む[linux]リモート接続プチフリ問題
linuxのサーバーのHDDアクセスが頻
続きを読む[linux]勝手にターミナルが落ちる問題（OOM-Killerをmaskする）
alphafoldクラスターの一部のPC
続きを読む[bioinfo]bamファイルから特定のリファレンスにマップされたリードをfastqで取り出す
samtoolsのワンライナーで可能。
続きを読む[linux]WANに接続できなくなった場合の対処法
https://blog.yyyak.c
続きを読む[bioinfo]NCBIのIDから遺伝子名、種名などの情報を引き出す
NCBIからfastaファイルを引っ張て
続きを読む[linux]Linux上でリモート接続するPCのIPを検索する
linuxあるいは、WindowsのWS
続きを読む[bioinfo]Windows上にanacondaを使ってDeepLabCutをインストールする。
前提として、windows上にCUDAと
続きを読む[bioinfo] windows 11のWSL（Ubuntu 22.04）にDeepLabCutをインストールする
動物の行動解析に有用なツールDeepLa
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