プロトコル

[bioinfo]Platanus-alleeの最新版とアーカイブサイト

platanus-alleeは東工大において開発されたハイブリッドアセンブラ。現在、更新は止まっているが、同じく東工大で開発されたHi-CリードによるScaffoldingも行えるGreenhillの中にPlatanus-alleeが組み込まれており、bug-fixされた最新版がダウンロードできる。

https://web.archive.org/web/20250106101717/https://platanus.bio.titech.ac.jp/platanus2

https://github.com/ShunOuchi/GreenHill

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