[bioinfo]multiple fasta形式のデータから必要なデータのみを取り出す
まず、必要なfastaデータのIDを改行で区切ってテキストファイルに出力しておき、seqkitのgrepをwhileループで動かす。
while read line; do seqkit grep ./multiple.fasta -np "$line" -o "$line".fasta; done < id_list
まず、必要なfastaデータのIDを改行で区切ってテキストファイルに出力しておき、seqkitのgrepをwhileループで動かす。
while read line; do seqkit grep ./multiple.fasta -np "$line" -o "$line".fasta; done < id_list